Taman Pendidikan al-Qur’an (TPQ) Salafiyah berembrio dari pengajian al-Qur’an di musholla Salafiyah yang sudah ada semenjak tahun 50-an (1950), dengan memakai metode Baghdadi. Pengajian dan pembelajaran al-Qur’an ini bertujuan untuk mendidik para santri agar menjadi generasi muslim yang Qur’ani, sebagai modal untuk mereka dalam menggali pengetahuan agama Islam yang lebih luas.

Pengajian pembelajaran al-Qur’an ini diikuti oleh para santri, baik yang tinggal di dalam pondok maupun dari luar pondok Salafiyah. Memasuki tahun 90-an, pengajian pembelajaran al-Qur’an ini berkembang pesat dengan semakin banyaknya santri yang ikut serta dalam ta’lim tersebut. Hingga akhirnya pada tahun 2003, Yayasan Salafiyah meresmikan pengajian dan pembelajaran al-Qur’an ini dengan nama Taman Pendidikan Al-Qur’an Salafiyah.
Sejak tahun itu pula, pengajian pembelajaran al-Qur’an ini dikembangkan dengan beberapa perubahan untuk meningkatkan kualitas pendidikannya. Kitab dan metode yang dipakai, diubah dari metode Baghdadi menjadi metode Qiro’ati, dengan tambahan pelajaran pada tajwid dengan memakai buku Tajwid Praktis. Kurikulum juga ditambah dengan hafalan surat-surat pendek, do’a harian dan praktek ibadah.

Pengajian TPQ ini dilaksanakan setiap hari pada jam 6.30 waktu Istiwa’ (bada Maghrib). Dengan ditangani oleh 10 orang ustadz lebih, dari para santri Salafiyah senior maupun guru tetap di Madrasah Salafiyah, hingga saat ini TPQ Salafiyah telah mempunyai sekitar 140 orang santri lebih. Setelah lulus, para santri TPQ akan melanjutkan ke jenjang Madrasah, yaitu Madrasah Ibtida’iyah Salafiyah.